A Web Of Science-basert scientometrisk analyse av pattedyrmålet for en rapamycin-signalvei ved nyresykdom fra 1986 til 2020, del 2

Gjennomgang av milepælsforfattere og litteratur 

A total of 14,045 researchers had published the 2,585 manuscripts and the number of authors in every paper on average was 5.43. We used CiteSpace and VOSviewer to analyze co-authorship and citation networks among authors and to reveal the most highly cited researchers and collaboration among researchers. "Key researcher" was referred to as someone whose literature had been cited more than 500 times (global citation score >500). Nodene indikerte forskjellige forskere. Linjer mellom noder representerte samarbeidet mellom forfattere, og størrelsen på noden viste antall artikler publisert av forfatteren (Figur 3C, D). Linehan WM, Schmidt LS, Sommerer C, Kasinath BS, Aburatani H og Baba M ga enestående bidrag til forskningen av mTOR-signalveien inyresykdom. Linehan WM publiserte 24 artikler innen dette forskningsområdet. Linehan WM, Schmidt LS og Huber TB, som kan betraktes som ledere av dette forskningsområdet, mottok hver over 1,000 siteringer. Linehan WM og Aburatani H samarbeidet om mange artikler, men deres samarbeid med Kwiatkowski DJ var ikke så hyppig (Figur 3D). De 2585 typer litteratur om mTOR-signalveier inyresykdomsiterte også hverandre eller noen få andre studier i sine referanser. Vi brukte CiteSpace til å analysere 71 544 referanser av komposisjonene deres og produsere de 20 sterkeste siteringsutbruddene og et strømlinjeformet samsiteringsnettverk (Figur 3E, F). Tallet for siteringer av disse publikasjonene økte plutselig i løpet av en periode, som avslørte den raske aksepten og spredningen i de spesifikke forskningsområdene og inntok svært viktige posisjoner i kunnskapsrammen.

Nøkkelord og MeSH termer visualisering

Forekomstfrekvensen og tidstrenden for søkeord og MeSH-termer ble visualisert av programmet til CiteSpace og VOSviewer. Å trekke ut nøkkelkonsepter for mTOR inyresykdom, brukte vi Carrot2-systemet til å analysere store emner. Det var topp 6 søkeord i den røde rammen, som representerte den høyeste forekomsten med "Recipients Transplanted", "Undersøkt effekten avmTOR", "Akt Expression", "Target Genes", "Mammalia Target of Rapamycin Signaling" og "Therapy to a Mammalian Target of Rapamycin" (Figur 4A). Basert på CiteSpace ble samsiteringsnettverket segmentert i forskjellige forskjellige klynger fra titlene på de siterte artiklene (Figur 4B) Nettverksvisualisering av nøkkelord og klyngeundersøkelse av mTOR var basert på VOSviewer-programmet (Figur 4C, D).

Programvaren til CiteSpace ble brukt til å analysere tidssonevisningen og en tidslinjevisning avmTORsignalvei inyresykdomsamsiteringsnettverk. Tidspunktet for publisering ble avslørt øverst i visningen. Figuren for noder i en horisontal linje representerte viktigheten av studiefeltet og koblingen mellom noder reflektert sitering. Tidslinjevisningen viste også forekomsten, populariteten og nedgangen til forskningsemner i de mest typiske publikasjonene.

Figur 4Visualisering av søkeord og MeSH-termer. (A) Nøkkelordanalysen for mTOR-signalveien ved nyresykdom. (B) Klyngeanalysen av samsiteringsnettverk for mTOR-signalveien ved nyresykdom. (C) Nettverksvisualisering av søkeord. (D) Varmekart over nøkkelord.

I mellomtiden reflekterte klynger de tidsmessige egenskapene til forskningsområdene i tidslinjevisningen. Utviklingen av klynge 10 (bindende protein) viste den tidlige utforskningen av mTOR-veien inyreforskning med fokus på binding av protein, som skjedde tidligst. Klynge 0 (nyretransplantasjon), klynge 1 (autosomal dominant polycystisknyresykdom), klynge 4 (nyrecellekarsinom), klynge 5 (diabetisk nefropati), klynge 7 (renal angiomyolipom) og klynge 13 (ikke-glykemiske sykdommer) var aktuelle forskningsfronter og fokus (Figur 5A). Analyseresultatene av søkeordene tidslinjen avdekket kalsineurinhemmer, diabetisk nefropati, autosomal dominant polycystisknyresykdom,og tuberøs sklerosekompleks (figur 5B). Nåværende forskning fokuserer på mekanismen og komplikasjonene avnyresykdom. Tidssonevisningen av klyngenoder ble illustrert da samsiteringsnettverket siterte publikasjoner, som også kunne demonstrere forskningsfremgangen over tid (Figur 5C). Og den sentrale sammenhengen mellom tidssoner avslørte i hvilken grad meldingen manglet eller meldingen ble kvittert for å stimulere til avsløringer og fremme etterforskning. Hvis det var flere typer litteratur i en tidssonevisualisering, ville det vært en betydelig periode (Figur 5C).

Dual-map-analyse ble brukt for å indikere og generere vitenskapelige forbindelser og bidrag. Det siterte omrisset er på venstre halvdel og det siterte omrisset er på høyre halvdel. Sitatassosiasjonslinjen i bane fra en region til en annen vil illustrere forståelse av inter-spesialitetsrelasjoner, og dermed drive forbindelser og kunnskap om forskjellige forskningsfelt (Figur 5D).

Figur 5Tidssonevisning av klyngenoder og tidslinjevisualisering av nøkkelord og MeSH-termer. (A) Visualiseringen av begrepet tidslinje fra 1986 til 2020. (B) Visualiseringen av søkeords tidslinje fra 1986 til 2020. (C) Visualiseringen av tidssonevisningen av klyngenoder. (D) Dual-map overlays av publikasjoner om mTOR i nyresykdom.

Diskusjon 

Til forskjell fra tradisjonelle oversikter, kan bibliometrisk analyse systematisk behandle manuskripter innen relaterte forskningsområder for å få mer intuitive og tydelige resultater. For nye forskere til spesifikke områder kan det være nyttig å følge de nåværende studiefokusene og generelle trendene og avsløre landemerkende typer litteratur på feltet. Videre er det enkelt og brukervennlig å betjene dagens bibliometriske analyseprogramvare. I den nåværende forskningen presenterte vi en bibliometrisk analyse angående mTOR-signalveien inyresykdom.

I følge relevante studier har forskning på bruk av stamceller og et kinesisk urtemiddel for behandling avnyresykdommerhar fått stor oppmerksomhet. Hovedmekanismen til de to terapiene er å fremme reparasjon av skadet nyrevev ogbeskytte de gjenværende nyrefunksjonene.

Det kinesiske urtemiddelet,cistanche, har blitt brukt i tradisjonell kinesisk medisin for å behandle ulike kroniskenyresykdommerSiden gamledager. Det er rapportert atcistanchehar potensial til å redusere betennelse,redusere nyrefibroseog fremme syntesen av ekstracellulære matrikskomponenter. Det har blitt avslørt at disse effektene skyldes dets bioaktive komponenter, inkludert mange fenoliske stoffer, triterpenoider og kumariner.

Klikk her for å vite om organisk Cistanche for nyresykdom

Spør om mer:

david.deng@wecistanche.com WhatApp:86 13632399501

På den annen side har stamcelleteknologi forårsaket en revolusjon i medisinsk praksis. Forskning har vist at stamceller kan differensiere seg til ulike typer nyreceller og utføre terapeutiske aktiviteter, inkludert å beskytte det gjenværende funksjonelle nyrevevet, bremse vevsfibrose og reparere skadet nyrevev.

Til syvende og sist kan kombinasjonen av tradisjonell kinesisk medisin med moderne vitenskap være nøkkelen til å behandle ulikenyresykdommer.Denne strategien har gradvis blitt akseptert av det medisinske miljøet, og studier har allerede vist at kombinert terapi med cistanche- og stamcellebehandling kan redusere dødeligheten avnyresykdommer. 

Avslutningsvis, bruk av cistanche og stamcellebehandling i behandlingen avnyresykdommerviser stort potensial og krever videre forskning. Den kombinerte behandlingen av de to behandlingene kan gi et forbedret behandlingsalternativ for de som står overfornyresykdommer.

Basert på resultatene ble totalt 2 585 typer litteratur med 71 544 referanser hentet fra WoSCC. Tallet for manuskripter øker per år. Selv om mTOR-signalveien er en gren av den samlede forskningen tilnyrer, har forskningstrenden gradvis økt nylig (figur 2A). USA, Kina og Tyskland er mer fremtredende på dette feltet, og står for 55,7 prosent av publikasjonene. Fem av de 20 mest produktive institusjonene er i USA (tabell 1), noe som viser at kvaliteten på litteraturen utgitt av amerikanske institusjoner er høyere. Forskningsinstitusjoner, som Harvard University (Figur 2F, G, H), er relativt modne på dette spesifikke området og kan betraktes som betydelige institusjoner for læring og videre samarbeid. Disse resultatene indikerer at USA inntar sin ledende posisjon i mTOR-signalveien inyresykdom, hovedsakelig reflektert i internasjonale samarbeid, totalt antall siteringer og publikasjonstall. Spesielt sammenlignet med Tyskland og England har publikasjoner fra andre europeiske land som Italia og Sveits økt dramatisk etter 2014, noe som viser at mer utviklede land/regioner vil vie seg til videre undersøkelser på dette området (Figur 2E).

Tidsskrifter i samme klynge har samme forskningsområde. Ved å bruke funksjonen til VOSviewer-programvaren delte vi topp 100 journaler i tre klynger (figur 3B). Basert på CiteSpace ble hele forskningsfeltene oppdaget og delt inn i fjorten undergrupper, og de største syv klyngene er utstilt i figur 4B, inkludert klynge 0 "nyretransplantasjon", klynge 1 "autosomal dominant polycystisknyresykdom", klynge 2 "nyretransplantasjon", klynge 3 "nyrecellekarsinom", klynge 4 "hamartin", klynge 5 "autofagi" og klynge 6 "tuberøs sklerosekompleks". Klynge 3 "nyrecellekarsinom" indikerer at mTOR er signifikant i forskningen på nyrecellekarsinom (RCC) og at den antiproliferative egenskapen til mTOR-hemmere kan undertrykke svulstvekst RCC ligger på sjuende og niende plass blant henholdsvis menn og kvinner, og antallet nye krefttilfeller vil øke i fremtiden (29) Kirurgisk reseksjon er hovedmetoden for behandling av svulster som er begrenset til nyrene Omtrent en tredjedel av pasientene har fjernmetastaser, og de fleste tilfeller er uhelbredelige Interferon er mye brukt i translokasjon av nyrecellekarsinom, men dets effekt og toleranse er begrenset. Derfor kommer nye terapeutiske mål for mTOR i fokus (30,31). Vi brukte CiteSpace til å utføre samsiteringsanalyse og bestemte flere milepælslitteratur (Figur 3F). For eksempel avslørte Linehan WM det genetiske grunnlaget for RCC og rollen til mTOR-veien i dens patogenese (32). Hudes et al. vurderte også temsirolimus en mTOR-hemmer for RCC (33). Serra et al. evaluert sirolimus og nyrevekst i autosomal dominant polycystisknyresykdom(34). Arbeidet til Laplante et al. har den største siteringsutbruddet (figur 3F): mTOR-signalering i vekstkontroll og sykdom (4). Shillingford et al. utdypet at mTOR-veihemmingen kunne reversere nyrecystogenese i polycystisknyresykdom(35). Manuskriptet ble inkludert i klynge 1 "autosomal dominant polycystisknyresykdom" og klynge 5 "autofagi".

Lesere kan autoritativt gjenkjenne mekanismen til mTOR inyretransplantasjon, nyrekreft og nyre tuberøs sklerosekompleks, og deres behandling avnyresykdomgjennom disse milepælmanuskriptene. I henhold til figurene 5A og B, utviklingen av mTOR inyresykdomover en bestemt tid vises tydelig. Calcineurin-hemmer er et forsknings-hotspot og forskere har illustrert sammenligningen av calcineurin-hemmere og mTOR-hemmere for å behandlenyresykdom(13,36,37). I tillegg har forskningen på mTOR-signalveien inyresykdomkan begynne relatert til mTOR (38-40). Vi brukte VOSviewer og Carrot2 for å gjenkjenne viktige nøkkelord (Figur 4A, C, D). Blant hotspotene i figur 4C, D er det flere navn på medikamenter, som rapamycin, sirolimus, everolimus og så videre. I 1999 godkjente US Food and Drug Administration (FDA) markedsføring av rapamycin som et nytt behandlingsalternativ for å forhindre organavstøting hos nyretransplanterte (41). Derfor er forskning på rapamycin hovedsakelig konsentrert rundt 2000 (Figur 4C). I mars 2010 har everolimus fått godkjenning fra US FDA og European Medicines Agency for behandling av avansert RCC og nyretransplantasjon (42). Og derfor fokuserte forskningen på everolimus og nyretransplantasjon stort sett på 2010 (figur 4C). Vi analyserte tidstrender for søkeord av CiteSpace (Figur 5A, B, C). Diabetisk nefropati,nyretransplantasjon, autosomal dominant polycystisk nyresykdom, tuberøs sklerosekompleks, nyrecellekarsinom og autofagi kan være forskningsfokus i løpet av de neste årene.

I følge dual-map overlays (Figur 5D), forteller sitasjonsbanen oss at medisin og biologi er de dominerende områdene i mTOR-signalveien inyresykdom, og mTOR har liten relasjon til andre disipliner. Chiew et al. har fremstilt en tredimensjonal plattform ved å bruke en fluorescensresonansenergioverføringsbasert kaspase-3-sensor for å oppdage den apoptotiske evnen til mTOR-hemmere (43). Med videre forskning om mTOR-signaleringnyresykdom, vil andre fag etter hvert bli involvert. Denne studien har imidlertid noen begrensninger, som må vurderes når man analyserer resultatene av forskningen. For det første er litteraturen kun hentet fra WoSCC Database, noe som kan resultere i ufullstendig dokumentinnhenting. For det andre har vi oppdaget noen klynger, som leverhemangiom og tykktarmsepitelceller, som ikke er nært beslektet mednyresykdom.

Konklusjoner

Fremtidige forskningshotspots vil legemliggjøre diabetisk nefropati,nyretransplantasjon, autosomal dominant polycystisknyresykdom,tuberøs sklerosekompleks, nyrecellekarsinom og autofagi. Basert på ulike vitenskapelige metoder kan det gi fremtidig forskningsretning for de som er nye på dette området.

Anerkjennelser

Finansiering: Dette arbeidet ble støttet av National Natural Science Foundation of China (stipendnummer 81703851).

Referanser

1. Aleman JO, Eusebi LH, Ricciardiello L, et al. Mekanismer for fedme-indusert gastrointestinal neoplasi. Gastroenterology 2014;146:357-73.

2. D'Agati VD, Chagnac A, de Vries AP, et al. Fedme-relatert glomerulopati: kliniske og patologiske egenskaper og patogenese. Nat Rev Nephrol 2016;12:453-71.

3. Blandino-Rosano M, Barbaresso R, Jimenez-Palomares M, et al. Tap av mTORC1-signalering svekker betacellehomeostase og insulinprosessering. Nat Commun 2017;8:16014.

4. Laplante M, Sabatini DM. mTOR-signalering i vekstkontroll og sykdom. Cell 2012;149:274-93.

5. Li J, Kim SG, Blenis J. Rapamycin: ett medikament, mange effekter. Cell Metab 2014;19:373-9.

6. Uno K, Yamada T, Ishigaki Y, et al. En hepatisk aminosyre/mTOR/S6K-avhengig signalvei modulerer systemisk lipidmetabolisme via nevronale signaler. Nat Commun 2015;6:7940.

7. Kim K, Qiang L, Hayden MS, et al. mTORC1- uavhengig Raptor forhindrer hepatisk steatose ved å stabilisere PHLPP2. Nat Commun 2016;7:10255.

8. Han J, Li E, Chen L, et al. CREB-koaktivatoren CRTC2 kontrollerer hepatisk lipidmetabolisme ved å regulere SREBP1. Nature 2015;524:243-6.

9. Lipton JO, Sahin M. Nevrologien til mTOR. Neuron 2014;84:275-91.

10. Bockaert J, Marin P. mTOR i hjernefysiologi og patologier. Physiol Rev 2015;95:1157-87.

11. Crino PB. mTOR-signalkaskaden: baner nye veier for å kurere nevrologisk sykdom. Nat Rev Neurol 2016;12:379-92.

12. Ardestani A, Lupse B, Kido Y, et al. mTORC1-signalering: Et tveegget sverd i diabetiske betaceller. Cell Metab 2018;27:314-31.

13. Fantus D, Rogers NM, Grahammer F, et al. Roller av mTOR-komplekser i nyrene: implikasjoner for nyresykdom og transplantasjon. Nat Rev Nephrol 2016;12:587-609.

14. Shiels PG, McGuinness D, Eriksson M, et al. Epigenetikkens rolle i nyrealdring. Nat Rev Nephrol 2017;13:471-82.

15. Orhon I, Dupont N, Zaidan M, et al. Primærciliumavhengig autofagi kontrollerer epitelcellevolumet som respons på væskestrøm. Nat Cell Biol 2016;18:657-67.

16. Grahammer F, Nesterov V, Ahmed A, et al. mTORC2 regulerer kritisk nyrekaliumhåndtering. J Clin Invest 2016;126:1773-82.

17. MacKeigan JP, Krueger DA. Differensiering av mTOR-hemmere everolimus og sirolimus i behandlingen av tuberøs sklerosekompleks. Neuro Oncol 2015;17:1550-9.

18. Menezes LF, Germino GG. Patobiologien til polycystisk nyresykdom fra et metabolsk synspunkt. Nat Rev Nephrol 2019;15:735-49.

19. Gui Y, Lu Q, Gu M, et al. Fibroblast mTOR/PPARgamma/HGF-aksen beskytter mot tubulær celledød og akutt nyreskade. Cell Death Differ 2019;26:2774-89.

20. Choueiri TK, Je Y, Sonpavde G, et al. Forekomst og risiko for behandlingsrelatert dødelighet hos kreftpasienter behandlet med pattedyrmålet av rapamycinhemmere. Ann Oncol 2013;24:2092-7.

21. Gimpel C, Bergmann C, Bockenhauer D, et al. Internasjonal konsensuserklæring om diagnose og behandling av autosomal dominant polycystisk nyresykdom hos barn og unge. Nat Rev Nephrol 2019;15:713-26.

22. Allison SJ. Glomerulær sykdom: mTOR i FSGS. Nat Rev Nephrol 2017;13:260.

23. van Eck NJ, Waltman L. Sitasjonsbasert gruppering av publikasjoner ved bruk av CitNetExplorer og VOSviewer. Scientometrics 2017;111:1053-70.

24. Chen C, Song M. Visualisering av et forskningsfelt: En metodikk for systematiske scientometriske oversikter. PLoS One 2019;14:e0223994.

25. Schargus M, Kromer R, Druchkiv V, et al. De 100 beste papirene i tørre øyne - En bibliometrisk analyse. Ocul Surf 2018;16:180-90.

26. Sugimoto CR, Ahn YY, Smith E, et al. Faktorer som påvirker kjønnsrelatert rapportering i medisinsk forskning: en tverrfaglig bibliometrisk analyse. Lancet 2019;393:550-9.

27. Fedewa MV, Hathaway ED, Ward-Ritacco CL. Effekt av treningstrening på C-reaktivt protein: en systematisk gjennomgang og metaanalyse av randomiserte og ikke-randomiserte kontrollerte studier. Br J Sports Med 2017;51:670-6.

28. Yu L, McPhee CK, Zheng L, et al. Avslutning av autofagi og reformering av lysosomer regulert av mTOR. Nature 2010;465:942-6.

29. Siegel RL, Miller KD, Jemal A. Kreftstatistikk, 2019. CA Cancer J Clin 2019;69:7-34.

30. Haas NB, Appleman LJ, Stein M, et al. Autofagi-hemming for å øke mTOR-hemming: en fase I/II-studie av Everolimus og hydroksyklorokin hos pasienter med tidligere behandlet nyrecellekarsinom. Clin Cancer Res 2019;25:2080-7.

31. Xu J, Pham CG, Albanese SK, et al. Mekanistisk distinkte kreftassosierte mTOR-aktiveringsklynger forutsier følsomhet for rapamycin. J Clin Invest 2016;126:3526-40.

32. Linehan WM, Schmidt LS, Crooks DR, et al. Det metabolske grunnlaget for nyrekreft. Cancer Discov 2019;9:1006-21.

33. Hudes G, Carducci M, Tomczak P, et al. Temsirolimus, interferon alfa eller begge for avansert nyrecellekarsinom. N Engl J Med 2007;356:2271-81.

34. Serra AL, Poster D, Kistler AD, et al. Sirolimus og nyrevekst ved autosomal dominant polycystisk nyresykdom. N Engl J Med 2010;363:820-9.

35. Shillingford JM, Murcia NS, Larson CH, et al. mTOR-veien reguleres av polycystin-1, og hemmingen reverserer nyrecystogenese ved polycystisk nyresykdom. Proc Natl Acad Sci USA 2006;103:5466-71.

36. Guo Z, Hong SY, Wang J, et al. Rapamycin-inspirerte makrosykluser med ny målspesifisitet. Nat Chem 2019;11:254-63.

37. Budde K, Becker T, Arns W, et al. Everolimus-basert, calcineurin-hemmer-fri diett hos mottakere av de-novo nyretransplantasjoner: en åpen, randomisert, kontrollert studie. Lancet 2011;377:837-47.

38. Henske EP, Jozwiak S, Kingswood JC, et al. Tuberøs sklerosekompleks. Nat Rev Dis Primers 2016;2:16035.

39. Narita M, Young AR, Arakawa S, et al. Romlig kobling av mTOR og autofagi forsterker sekretoriske fenotyper. Science 2011;332:966-70.

40. Natoli TA, Smith LA, Rogers KA, et al. Hemming av glukosylceramidakkumulering resulterer i effektiv blokkering av polycystisk nyresykdom i musemodeller. Nat Med 2010;16:788-92.

41. Miller JL. Sirolimus godkjent med nyretransplantasjonsindikasjon. Am J Health Syst Pharm 1999;56:2177-8.

42. StatBite: FDA godkjenninger av onkologiske legemidler i 2009. J Natl Cancer Inst 2010;102:219.

43. Chiew GGY, Wei N, Sultania S, et al. Biokonstruert tredimensjonal samkultur av kreftceller og endotelceller: Et modellsystem for dobbel analyse av tumorvekst og angiogenese. Biotechnol Bioeng 2017;114:1865-77.

Be om mer: david.deng@wecistanche.com