Enkeltcelle og immunitet: Bedre forståelse av immuncelleheterogeniteter med enkeltcellesekvensering

Dec 15, 2023

Den delikate balansen av immunitet formidles av hyppig krysstale og kompliserte interaksjoner mellom ulike celletyper. Immunceller er svært heterogene i celletyper og aktiveringsstatus. Metoder for sekvensering av vev og bulkceller fanger opp de generelle signaturene fra blandede prøver, med de subtile gensignaturene fra sjeldne, men funksjonelt viktige celletyper dekket av rikelig cellepopulasjoner.

Cistanche deserticola-improve immunity

cistanche tubulosa-forbedre immunsystemet

Videre er intra- og intercellulær kommunikasjon som bærer viktige ledetråder for immuncelleproliferasjon, differensiering, modning, migrasjon og overgang vanskelig å karakterisere ved bruk av tradisjonelle metoder. Den nåværende spesialutgaven hadde som mål å fokusere på den raske progresjonen av enkeltcellebaserte studier på smittsom immunitet, kreftimmunologi, medfødt immunitet og immunsystemforstyrrelser, som vist i figur 1.

Desert ginseng-Improve immunity (12)

cistanche fordeler for menn styrker immunforsvaret

Enkeltcellesekvensering har vitenskapelig innvirkning på klinisk og translasjonell oppdagelse. I det siste tiåret har enkeltcellet RNA-sekvensering (scRNA-seq) utløst en sann revolusjon innen immunologisk forskning. Som encellede molekylære profileringsverktøy gir scRNA-seq-teknologier en bedre forståelse av heterogeniteten assosiert med individuelle immunceller og responsene på molekylære nivåer under fysiologiske og patologiske forhold.1 De enkeltcellesekvenseringsbaserte studiene har med suksess identifisert nye immuncelleundergrupper og utviklingsbaner.2 Smittsomme sykdommer og kreftformer utgjør en akutt trussel mot menneskers helse. Hvordan vi skal oversette vår forståelse av den molekylære mekanismen for immunregulering til kliniske terapier er fortsatt en stor utfordring.

Desert ginseng-Improve immunity (15)

cistanche planteøkende immunsystem

Klikk her for å se Cistanche Enhance Immunity-produkter

【Be om mer】 E-post:cindy.xue@wecistanche.com / Whats App: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

Med scRNA-seq-teknologi har store gjennombrudd blitt oppnådd. For eksempel ble de distinkte immunresponsveiene mellom infeksjoner med influensa A-virus og alvorlig akutt respiratorisk syndrom coronavirus-2 (SARS-CoV-2) avdekket ved encellet oppløsning.3 SARS-CoV{{ 7}}nøytraliserende antistoffer ble identifisert ved bruk av scRNA-seq av antigen-anrikede B-celler fra COVID{10}}-pasienter.4 Kryssvevsimmunatlaset og utviklingsimmunatlaset til mennesker ble systematisk konstruert.5,6 scRNA-seq. teknologi har vist seg å være et potent verktøy for å avsløre mekanismer for immunflukt i tumorvev.7

FIGURE 1 The topic of single cell and immunity is mainly focused on immune system disorders, infectious immunity, cancer immunity, inflammatory immunity, virus-associated immunity, and innate immunity. Schematic diagrams were created with BioRender.com.


FIGUR 1 Emnet enkeltcelle og immunitet er hovedsakelig fokusert på forstyrrelser i immunsystemet, infeksjonsimmunitet, kreftimmunitet, inflammatorisk immunitet, virusassosiert immunitet og medfødt immunitet. Skjematiske diagrammer ble laget med BioRender.com.

Desert ginseng-Improve immunity (16)

cistanche tubulosa-forbedre immunsystemet

Det er rask fremgang i enkeltcelleanalyseverktøy. Et bredt utvalg av omfattende nettbaserte databaser ble utviklet for lagring og analyse av enkeltcelledatasett. En avgjørende oppgave er å standardisere merknaden til immunceller og utnytte hele spekteret av datatyper. Dette vil gjøre det mulig å samarbeide om dataanalyse mellom akademia, industri og kliniske institusjoner. Dermed vil den koordinerte innsatsen fra denne spesielle temautgaven fremme vår forståelse av immunologisk forskning og terapier.

Desert ginseng-Improve immunity (23)

cistanche tubulosa-forbedre immunsystemet

REFERANSER

1. Giladi A, Amit I. Encellet genomikk: et springbrett for fremtidige immunologiske oppdagelser. Celle. 2018;172(1):14-21. https://doi.org/ 10.1016/j.cell.2017.11.011

2. Papalexi E, Satija R. Encellet RNA-sekvensering for å utforske immuncelleheterogenitet. Nat Rev Immunol. 2018;18(1):35-45. https://doi.org/10.1038/nri.2017.76

3. Zhu L, Yang P, Zhao Y, et al. Enkeltcellesekvensering av perifere mononukleære celler avslører distinkte immunresponslandskap for COVID-19- og influensapasienter. Immunitet. 2020;53(3):685- 696. https://doi.org/10.1016/j.immuni.2020.07.009. e3.

4. Cao Y, Su B, Guo X, et al. Potente nøytraliserende antistoffer mot SARS-CoV-2 identifisert ved høykapasitets enkeltcellesekvensering av rekonvalescente pasienters B-celler. Celle. 2020;182(1):73-84. https://doi.org/10.1016/j.cell.2020.05.025. e16.

5. Suo C, Dann E, Goh I, et al. Kartlegging av det utviklende menneskelige immunsystemet på tvers av organer. Vitenskap. 2022;376(6597):eabo0510. https://doi.org/10.1126/science.abo0510

6. Domínguez Conde C, Xu C, Jarvis LB, et al. Kryssvevsimmuncelleanalyse avslører vevsspesifikke egenskaper hos mennesker. Vitenskap. 2022;376(6594):eabl5197. https://doi.org/10.1126/science.abl5197

7. Zhang Y, Wang D, Peng M, et al. Encellet RNA-sekvensering i kreftforskning. J Exp Clin Cancer Res. 2021;40(1):81. https://doi. org/10.1186/s13046-021-01874-1

8. Chen D, Tan C, Ding P, et al. VThunter: en database for encellet screening av virusmålceller i dyreriket. Nucleic Acids Res. 2022;50(D1):D934-D942. https://doi.org/10.1093/nar/ gkab894

9. Chen Y, Zhang X, Peng X, et al. SPEED: encellet pan-arter atlas i lys av økologi og evolusjon for utvikling og sykdommer. Nucleic Acids Res. https://doi.org/10.1093/nar/gkac930. Publisert på nett 28. oktober 2022:gkac930.

10. Han X, Wang R, Zhou Y, et al. Kartlegging av musecelleatlaset ved mikrobrønn-Seq. Celle. 2018;172(5):1091-1107. https://doi.org/10. 1016/j.cell.2018.02.001. e17.

11. Chen D, Sun J, Zhu J, et al. Encellet atlas for 11 ikke-modellpattedyr, krypdyr og fugler. Nat Commun. 2021;12(1):7083. https://doi.org/10.1038/s41467-021-27162-2

12. Han X, Zhou Z, Fei L, et al. Konstruksjon av et menneskelig cellelandskap på enkeltcellenivå. Natur. 2020;581(7808):303-309. https:// doi.org/10.1038/s41586-020-2157-4

13. Ma P, Liu X, Xu Z, et al. Felles profilering av genuttrykk og kromatintilgjengelighet under amphioxus-utvikling ved enkeltcelleoppløsning. Cell Rep. 2022;39(12). https://doi.org/10. 1016/j.celrep.2022.110979

Du kommer kanskje også til å like